In Metroid speel je met Samus Aran, een vrouwelijke premiejager gehuld in een multifunctioneel ruimtepak. Door het gehele universum moet ze klusjes opknappen in ruil voor een fikse premie. Ook in Metroid Prime staat Samus weer een klus te wachten, een klus die zijn weerga niet kent. De Space Pirates, een kwaadaardig stelletje 'ruimtepiraten' hebben zich op de planeet Tallon IV genesteld, om daar allerlei duistere experimenten uit te voeren. Tallon IV leent zich uitstekend voor dit soort experimenten, omdat de aarde van de planeet rijk is aan Phazon. Phazon is een goedje dat uitermate geschikt is voor het muteren van levende wezens. Samus komt de Space Pirates al snel op het spoor en vertrekt richting hun ruimteschip. Daar aangekomen wordt aan de speler voor het eerst de controle over Samus gegeven. Het ruimtestation van de ruimtepiraten dient als een soort oefenlevel, waarin je kunt wennen aan de nieuwe controls. Die nieuwe controls in combinatie met de gameplay deden ons onmiddellijk achterover slaan van verbazing. In positieve zin, dat wel.

 

Je speelt Metroid Prime vanuit het pak van Samus. Je kijkt door haar vizier, waardoor alles wat je bekijkt licht gebold is. Ook kun je op het vizier van Samus verschillende metertjes vinden, zoals een energiemeter en een radar. Het spel is dus weergegeven vanuit een first-person gezichtspunt. Als je voor het eerst het spel speelt, doet het spel heel erg denken aan een mooie first person shooter. Vijanden worden namelijk net als in van die ouderwetse shooters afgeknald met je wapen (in dit geval een up te graden high-tech wapen). Je kunt met de R-knop je vijanden in je vizier houden, zodat jij ze zelf in principe altijd raakt en ondertussen vijandelijk vuur met relatief gemak kunt omzeilen. Zodra je wat langer in het spel zit, zul je er echter achter komen dat er véél meer schuilt achter het spelconcept.

 

Klein voorbeeldje: op het ruimteschip waarvanuit je avontuur begint, kom je op een gegeven moment een enorme gesloten deur tegen. Het enige bruikbaar uitziende instrument in de kamer is een klein gaatje in de vloer. Na wat rommelen met de knopjes kom je uiteindelijk op de X-knop terecht. Plotseling transformeert Samus' pak van een rechtopstaand model tot een piepklein balletje. Dit balletje, de Morph Ball genaamd (wij noemen 'm liever bij de stoere Japanse naam: Maru Mari), geeft letterlijk en figuurlijk een heel ander perspectief op het probleem. In plaats van het eerste-persoons-beeld bestuur je plotseling het balletje vanuit een derde-persoons-oogpunt. De camera zweeft dus boven je balletje, terwijl jij rondrolt en met de A-knop zelfs bommetjes kunt plaatsen! Om de puzzel uit ons voorbeeldje op te lossen, moet je vervolgens met je balletje op het cirkeltje plaatsnemen. En voila: de deur opent zich! Met dit soort puzzeltjes, waarbij je (een combinatie van) al je technische snufjes moet gebruiken, zit Metroid Prime boordevol.